Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOEP02649 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOEP02649 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOEP02649 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOEP02649 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOEP02649 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOEP02649 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOEP02649 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOEP02649 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOEP02649 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOEP02649 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOEP02649 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOEP02649 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOEP02649 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOEP02649 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOEP02649 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOEP02649 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOEP02649 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
APOEP02649 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOEP02649 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOEP02649 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOEP02649 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
APOEP02649 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOEP02649 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOEP02649 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
APOEP02649 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
APOEP02649 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
APOEP02649 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOEP02649 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOEP02649 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOEP02649 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOEP02649 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOEP02649 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOEP02649 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOEP02649 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOEP02649 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOEP02649 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOEP02649 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOEP02649 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
APOEP02649 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOEP02649 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOEP02649 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOEP02649 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
APOEP02649 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOEP02649 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOEP02649 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOEP02649 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOEP02649 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
APOEP02649 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOEP02649 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOEP02649 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOEP02649 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOEP02649 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOEP02649 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
APOEP02649 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
APOEP02649 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
APOEP02649 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
APOEP02649 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
APOEP02649 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
APOEP02649 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
APOEP02649 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
APOEP02649 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
APOEP02649 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOEP02649 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOEP02649 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOEP02649 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOEP02649 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOEP02649 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOEP02649 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOEP02649 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOEP02649 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
APOEP02649 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
APOEP02649 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOEP02649 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOEP02649 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOEP02649 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOEP02649 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOEP02649 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOEP02649 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOEP02649 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOEP02649 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOEP02649 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
APOEP02649 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOEP02649 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APOEP02649 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOEP02649 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOEP02649 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
APOEP02649 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
APOEP02649 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
APOEP02649 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOEP02649 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOEP02649 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APOEP02649 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOEP02649 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOEP02649 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOEP02649 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APOEP02649 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APOEP02649 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOEP02649 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APOEP02649 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms