Protein–RNA interactions for Protein: P01871

IGHM, Immunoglobulin heavy constant mu, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMP01871 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGHMP01871 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGHMP01871 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGHMP01871 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGHMP01871 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGHMP01871 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGHMP01871 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHMP01871 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHMP01871 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHMP01871 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHMP01871 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGHMP01871 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHMP01871 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGHMP01871 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHMP01871 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHMP01871 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHMP01871 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHMP01871 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHMP01871 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHMP01871 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHMP01871 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHMP01871 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGHMP01871 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHMP01871 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHMP01871 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGHMP01871 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHMP01871 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHMP01871 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGHMP01871 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHMP01871 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHMP01871 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGHMP01871 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IGHMP01871 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHMP01871 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHMP01871 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHMP01871 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHMP01871 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGHMP01871 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHMP01871 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHMP01871 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHMP01871 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHMP01871 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHMP01871 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHMP01871 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHMP01871 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHMP01871 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHMP01871 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHMP01871 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHMP01871 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHMP01871 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHMP01871 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHMP01871 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHMP01871 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHMP01871 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHMP01871 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHMP01871 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHMP01871 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHMP01871 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHMP01871 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHMP01871 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHMP01871 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHMP01871 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHMP01871 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHMP01871 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHMP01871 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHMP01871 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHMP01871 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHMP01871 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHMP01871 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHMP01871 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHMP01871 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHMP01871 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHMP01871 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHMP01871 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHMP01871 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHMP01871 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHMP01871 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHMP01871 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHMP01871 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHMP01871 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHMP01871 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHMP01871 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHMP01871 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHMP01871 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHMP01871 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHMP01871 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHMP01871 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGHMP01871 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHMP01871 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHMP01871 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHMP01871 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHMP01871 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHMP01871 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHMP01871 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHMP01871 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHMP01871 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHMP01871 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHMP01871 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHMP01871 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGHMP01871 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms