Protein–RNA interactions for Protein: P01819

Ig heavy chain V region MOPC 141, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01819 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01819 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01819 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01819 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01819 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01819 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01819 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01819 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01819 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01819 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01819 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01819 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01819 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01819 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01819 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01819 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01819 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01819 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01819 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01819 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01819 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01819 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01819 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01819 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01819 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01819 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01819 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01819 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01819 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01819 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01819 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01819 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01819 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01819 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01819 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01819 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01819 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01819 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01819 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01819 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01819 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01819 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01819 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01819 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01819 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01819 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01819 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01819 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01819 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01819 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01819 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01819 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01819 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01819 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01819 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01819 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01819 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01819 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01819 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01819 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01819 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01819 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01819 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01819 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01819 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01819 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01819 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01819 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01819 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01819 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01819 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01819 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01819 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01819 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01819 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01819 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01819 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01819 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01819 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01819 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01819 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01819 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01819 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01819 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01819 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01819 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01819 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01819 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01819 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01819 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01819 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01819 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01819 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01819 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01819 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01819 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01819 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01819 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01819 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01819 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms