Protein–RNA interactions for Protein: P01755

Ig heavy chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01755 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01755 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01755 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01755 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01755 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01755 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01755 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01755 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01755 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01755 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01755 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01755 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01755 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01755 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01755 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01755 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01755 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01755 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01755 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01755 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01755 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01755 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01755 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01755 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01755 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01755 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01755 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01755 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01755 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01755 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01755 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01755 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01755 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01755 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01755 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01755 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01755 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01755 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01755 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01755 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01755 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01755 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01755 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P01755 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01755 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01755 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01755 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01755 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01755 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01755 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01755 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01755 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01755 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01755 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01755 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01755 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01755 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01755 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01755 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01755 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01755 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01755 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01755 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01755 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01755 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01755 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01755 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01755 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01755 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01755 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01755 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01755 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01755 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01755 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01755 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01755 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01755 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01755 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01755 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01755 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01755 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01755 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
P01755 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01755 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01755 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01755 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01755 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01755 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01755 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01755 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01755 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01755 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01755 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01755 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01755 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01755 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01755 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01755 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01755 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01755 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms