Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01747 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P01747 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01747 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
P01747 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01747 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01747 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
P01747 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01747 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01747 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01747 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01747 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01747 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01747 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01747 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01747 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01747 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01747 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01747 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01747 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01747 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01747 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01747 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
P01747 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01747 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01747 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01747 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01747 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01747 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01747 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01747 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01747 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01747 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01747 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01747 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01747 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01747 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01747 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01747 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01747 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01747 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01747 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01747 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01747 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01747 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01747 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01747 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01747 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01747 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01747 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01747 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01747 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01747 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01747 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01747 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01747 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01747 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01747 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01747 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01747 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01747 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01747 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01747 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01747 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01747 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01747 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01747 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01747 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01747 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01747 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01747 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01747 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01747 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01747 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01747 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01747 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01747 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01747 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01747 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01747 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01747 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01747 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01747 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01747 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01747 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01747 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
P01747 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
P01747 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01747 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01747 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01747 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01747 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01747 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01747 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01747 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01747 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01747 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01747 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01747 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01747 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms