Protein–RNA interactions for Protein: P01732

CD8A, T-cell surface glycoprotein CD8 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8AP01732 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD8AP01732 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD8AP01732 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD8AP01732 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD8AP01732 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD8AP01732 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD8AP01732 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD8AP01732 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD8AP01732 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD8AP01732 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD8AP01732 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD8AP01732 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD8AP01732 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD8AP01732 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD8AP01732 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD8AP01732 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD8AP01732 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD8AP01732 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD8AP01732 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CD8AP01732 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD8AP01732 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CD8AP01732 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD8AP01732 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD8AP01732 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD8AP01732 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD8AP01732 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD8AP01732 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD8AP01732 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD8AP01732 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD8AP01732 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD8AP01732 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD8AP01732 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD8AP01732 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD8AP01732 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD8AP01732 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD8AP01732 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD8AP01732 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD8AP01732 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD8AP01732 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD8AP01732 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD8AP01732 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD8AP01732 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD8AP01732 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD8AP01732 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD8AP01732 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD8AP01732 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD8AP01732 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD8AP01732 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD8AP01732 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD8AP01732 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD8AP01732 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD8AP01732 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD8AP01732 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD8AP01732 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD8AP01732 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD8AP01732 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD8AP01732 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD8AP01732 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD8AP01732 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD8AP01732 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD8AP01732 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD8AP01732 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD8AP01732 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD8AP01732 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CD8AP01732 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD8AP01732 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD8AP01732 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD8AP01732 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD8AP01732 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD8AP01732 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD8AP01732 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD8AP01732 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD8AP01732 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD8AP01732 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD8AP01732 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD8AP01732 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD8AP01732 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD8AP01732 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD8AP01732 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD8AP01732 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD8AP01732 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD8AP01732 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD8AP01732 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD8AP01732 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD8AP01732 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD8AP01732 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD8AP01732 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD8AP01732 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD8AP01732 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD8AP01732 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD8AP01732 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CD8AP01732 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD8AP01732 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD8AP01732 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD8AP01732 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD8AP01732 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD8AP01732 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD8AP01732 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD8AP01732 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD8AP01732 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms