Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01679 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01679 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01679 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P01679 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01679 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01679 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01679 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01679 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01679 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
P01679 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01679 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01679 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01679 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01679 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01679 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01679 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01679 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01679 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01679 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01679 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01679 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01679 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01679 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01679 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01679 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01679 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P01679 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01679 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01679 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01679 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P01679 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01679 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01679 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P01679 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
P01679 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01679 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
P01679 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P01679 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01679 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01679 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01679 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01679 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01679 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01679 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01679 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01679 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
P01679 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
P01679 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P01679 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01679 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01679 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
P01679 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01679 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P01679 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01679 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01679 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01679 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01679 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01679 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
P01679 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01679 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01679 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
P01679 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
P01679 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
P01679 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01679 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01679 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01679 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01679 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01679 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01679 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P01679 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01679 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01679 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01679 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01679 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01679 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01679 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01679 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01679 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
P01679 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01679 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01679 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01679 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01679 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01679 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
P01679 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01679 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01679 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01679 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01679 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01679 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01679 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01679 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
P01679 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01679 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
P01679 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01679 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01679 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms