Protein–RNA interactions for Protein: P01189

POMC, Pro-opiomelanocortin, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMCP01189 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POMCP01189 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POMCP01189 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POMCP01189 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POMCP01189 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POMCP01189 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POMCP01189 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POMCP01189 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POMCP01189 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POMCP01189 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POMCP01189 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POMCP01189 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POMCP01189 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POMCP01189 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POMCP01189 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POMCP01189 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POMCP01189 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POMCP01189 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POMCP01189 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POMCP01189 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POMCP01189 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POMCP01189 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
POMCP01189 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POMCP01189 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POMCP01189 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POMCP01189 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POMCP01189 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
POMCP01189 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POMCP01189 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POMCP01189 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POMCP01189 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POMCP01189 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POMCP01189 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
POMCP01189 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POMCP01189 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POMCP01189 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POMCP01189 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POMCP01189 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POMCP01189 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POMCP01189 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POMCP01189 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POMCP01189 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POMCP01189 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POMCP01189 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POMCP01189 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POMCP01189 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
POMCP01189 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POMCP01189 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POMCP01189 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
POMCP01189 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POMCP01189 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POMCP01189 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POMCP01189 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POMCP01189 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
POMCP01189 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POMCP01189 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POMCP01189 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
POMCP01189 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POMCP01189 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POMCP01189 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POMCP01189 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POMCP01189 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POMCP01189 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POMCP01189 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POMCP01189 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POMCP01189 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
POMCP01189 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POMCP01189 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POMCP01189 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POMCP01189 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POMCP01189 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POMCP01189 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POMCP01189 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POMCP01189 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POMCP01189 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POMCP01189 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POMCP01189 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POMCP01189 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
POMCP01189 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POMCP01189 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
POMCP01189 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POMCP01189 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POMCP01189 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POMCP01189 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POMCP01189 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POMCP01189 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POMCP01189 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POMCP01189 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POMCP01189 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POMCP01189 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POMCP01189 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POMCP01189 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POMCP01189 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POMCP01189 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POMCP01189 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POMCP01189 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POMCP01189 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POMCP01189 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POMCP01189 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
POMCP01189 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms