Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SERPINA1P01009 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SERPINA1P01009 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SERPINA1P01009 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SERPINA1P01009 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SERPINA1P01009 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SERPINA1P01009 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SERPINA1P01009 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SERPINA1P01009 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SERPINA1P01009 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SERPINA1P01009 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SERPINA1P01009 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SERPINA1P01009 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SERPINA1P01009 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SERPINA1P01009 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SERPINA1P01009 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SERPINA1P01009 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SERPINA1P01009 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SERPINA1P01009 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SERPINA1P01009 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SERPINA1P01009 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SERPINA1P01009 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SERPINA1P01009 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SERPINA1P01009 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SERPINA1P01009 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SERPINA1P01009 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SERPINA1P01009 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SERPINA1P01009 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SERPINA1P01009 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SERPINA1P01009 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SERPINA1P01009 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SERPINA1P01009 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SERPINA1P01009 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SERPINA1P01009 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SERPINA1P01009 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SERPINA1P01009 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SERPINA1P01009 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SERPINA1P01009 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SERPINA1P01009 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SERPINA1P01009 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SERPINA1P01009 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SERPINA1P01009 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SERPINA1P01009 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SERPINA1P01009 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SERPINA1P01009 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SERPINA1P01009 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SERPINA1P01009 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SERPINA1P01009 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SERPINA1P01009 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms