Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SERPINC1P01008 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SERPINC1P01008 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SERPINC1P01008 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SERPINC1P01008 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SERPINC1P01008 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SERPINC1P01008 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SERPINC1P01008 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SERPINC1P01008 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SERPINC1P01008 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SERPINC1P01008 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SERPINC1P01008 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SERPINC1P01008 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SERPINC1P01008 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SERPINC1P01008 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SERPINC1P01008 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SERPINC1P01008 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SERPINC1P01008 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SERPINC1P01008 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SERPINC1P01008 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SERPINC1P01008 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SERPINC1P01008 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SERPINC1P01008 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SERPINC1P01008 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SERPINC1P01008 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SERPINC1P01008 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SERPINC1P01008 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SERPINC1P01008 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SERPINC1P01008 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SERPINC1P01008 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SERPINC1P01008 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SERPINC1P01008 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SERPINC1P01008 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SERPINC1P01008 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SERPINC1P01008 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SERPINC1P01008 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SERPINC1P01008 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SERPINC1P01008 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SERPINC1P01008 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SERPINC1P01008 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SERPINC1P01008 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SERPINC1P01008 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SERPINC1P01008 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SERPINC1P01008 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SERPINC1P01008 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SERPINC1P01008 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SERPINC1P01008 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SERPINC1P01008 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SERPINC1P01008 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SERPINC1P01008 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SERPINC1P01008 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SERPINC1P01008 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SERPINC1P01008 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SERPINC1P01008 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SERPINC1P01008 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SERPINC1P01008 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SERPINC1P01008 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SERPINC1P01008 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SERPINC1P01008 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SERPINC1P01008 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SERPINC1P01008 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SERPINC1P01008 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SERPINC1P01008 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SERPINC1P01008 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SERPINC1P01008 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SERPINC1P01008 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SERPINC1P01008 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SERPINC1P01008 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SERPINC1P01008 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SERPINC1P01008 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SERPINC1P01008 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SERPINC1P01008 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SERPINC1P01008 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SERPINC1P01008 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SERPINC1P01008 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SERPINC1P01008 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SERPINC1P01008 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SERPINC1P01008 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SERPINC1P01008 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SERPINC1P01008 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SERPINC1P01008 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SERPINC1P01008 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SERPINC1P01008 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SERPINC1P01008 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SERPINC1P01008 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SERPINC1P01008 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SERPINC1P01008 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SERPINC1P01008 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SERPINC1P01008 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SERPINC1P01008 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SERPINC1P01008 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SERPINC1P01008 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SERPINC1P01008 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms