Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C1RP00736 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C1RP00736 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C1RP00736 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C1RP00736 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C1RP00736 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C1RP00736 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C1RP00736 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C1RP00736 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C1RP00736 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C1RP00736 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
C1RP00736 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C1RP00736 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C1RP00736 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C1RP00736 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C1RP00736 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C1RP00736 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C1RP00736 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C1RP00736 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
C1RP00736 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C1RP00736 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C1RP00736 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C1RP00736 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C1RP00736 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C1RP00736 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C1RP00736 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C1RP00736 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C1RP00736 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C1RP00736 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C1RP00736 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C1RP00736 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C1RP00736 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C1RP00736 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C1RP00736 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
C1RP00736 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C1RP00736 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C1RP00736 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C1RP00736 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
C1RP00736 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
C1RP00736 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C1RP00736 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C1RP00736 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C1RP00736 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C1RP00736 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C1RP00736 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
C1RP00736 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C1RP00736 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C1RP00736 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
C1RP00736 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
C1RP00736 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C1RP00736 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C1RP00736 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
C1RP00736 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C1RP00736 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C1RP00736 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C1RP00736 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C1RP00736 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C1RP00736 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C1RP00736 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C1RP00736 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C1RP00736 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C1RP00736 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C1RP00736 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C1RP00736 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C1RP00736 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C1RP00736 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
C1RP00736 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
C1RP00736 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
C1RP00736 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C1RP00736 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
C1RP00736 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C1RP00736 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C1RP00736 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C1RP00736 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C1RP00736 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C1RP00736 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C1RP00736 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
C1RP00736 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C1RP00736 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C1RP00736 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C1RP00736 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C1RP00736 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C1RP00736 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C1RP00736 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C1RP00736 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C1RP00736 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C1RP00736 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C1RP00736 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C1RP00736 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C1RP00736 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C1RP00736 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C1RP00736 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C1RP00736 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C1RP00736 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C1RP00736 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C1RP00736 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
C1RP00736 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C1RP00736 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C1RP00736 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C1RP00736 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms