Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Abl1P00520 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abl1P00520 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abl1P00520 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abl1P00520 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abl1P00520 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abl1P00520 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abl1P00520 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Abl1P00520 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abl1P00520 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Abl1P00520 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abl1P00520 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abl1P00520 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abl1P00520 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abl1P00520 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abl1P00520 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abl1P00520 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abl1P00520 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abl1P00520 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abl1P00520 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abl1P00520 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abl1P00520 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abl1P00520 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abl1P00520 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abl1P00520 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abl1P00520 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abl1P00520 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abl1P00520 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abl1P00520 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abl1P00520 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abl1P00520 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abl1P00520 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abl1P00520 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abl1P00520 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abl1P00520 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abl1P00520 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Abl1P00520 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abl1P00520 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abl1P00520 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abl1P00520 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abl1P00520 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abl1P00520 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abl1P00520 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abl1P00520 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Abl1P00520 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Abl1P00520 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abl1P00520 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abl1P00520 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abl1P00520 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abl1P00520 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abl1P00520 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abl1P00520 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Abl1P00520 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abl1P00520 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abl1P00520 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abl1P00520 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abl1P00520 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abl1P00520 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abl1P00520 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abl1P00520 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abl1P00520 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Abl1P00520 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abl1P00520 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abl1P00520 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abl1P00520 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Abl1P00520 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abl1P00520 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abl1P00520 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abl1P00520 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abl1P00520 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abl1P00520 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abl1P00520 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abl1P00520 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Abl1P00520 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abl1P00520 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abl1P00520 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Abl1P00520 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Abl1P00520 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Abl1P00520 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abl1P00520 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Abl1P00520 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abl1P00520 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abl1P00520 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Abl1P00520 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Abl1P00520 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Abl1P00520 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Abl1P00520 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Abl1P00520 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Abl1P00520 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abl1P00520 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abl1P00520 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abl1P00520 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abl1P00520 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abl1P00520 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abl1P00520 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abl1P00520 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abl1P00520 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Abl1P00520 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Abl1P00520 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Abl1P00520 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms