Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
S1PR4O95977 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
S1PR4O95977 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
S1PR4O95977 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
S1PR4O95977 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
S1PR4O95977 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
S1PR4O95977 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
S1PR4O95977 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
S1PR4O95977 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
S1PR4O95977 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
S1PR4O95977 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
S1PR4O95977 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
S1PR4O95977 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
S1PR4O95977 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
S1PR4O95977 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
S1PR4O95977 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
S1PR4O95977 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
S1PR4O95977 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
S1PR4O95977 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
S1PR4O95977 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
S1PR4O95977 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
S1PR4O95977 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
S1PR4O95977 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
S1PR4O95977 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
S1PR4O95977 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
S1PR4O95977 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
S1PR4O95977 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
S1PR4O95977 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
S1PR4O95977 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
S1PR4O95977 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
S1PR4O95977 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
S1PR4O95977 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
S1PR4O95977 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
S1PR4O95977 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
S1PR4O95977 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
S1PR4O95977 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
S1PR4O95977 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
S1PR4O95977 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
S1PR4O95977 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
S1PR4O95977 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
S1PR4O95977 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
S1PR4O95977 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
S1PR4O95977 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
S1PR4O95977 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
S1PR4O95977 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
S1PR4O95977 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
S1PR4O95977 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
S1PR4O95977 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
S1PR4O95977 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
S1PR4O95977 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
S1PR4O95977 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
S1PR4O95977 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
S1PR4O95977 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
S1PR4O95977 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
S1PR4O95977 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
S1PR4O95977 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
S1PR4O95977 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
S1PR4O95977 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
S1PR4O95977 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
S1PR4O95977 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
S1PR4O95977 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
S1PR4O95977 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
S1PR4O95977 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
S1PR4O95977 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
S1PR4O95977 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
S1PR4O95977 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
S1PR4O95977 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
S1PR4O95977 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
S1PR4O95977 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
S1PR4O95977 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
S1PR4O95977 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms