Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPNE6O95741 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPNE6O95741 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPNE6O95741 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPNE6O95741 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPNE6O95741 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPNE6O95741 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CPNE6O95741 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPNE6O95741 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPNE6O95741 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPNE6O95741 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPNE6O95741 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPNE6O95741 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPNE6O95741 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPNE6O95741 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPNE6O95741 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPNE6O95741 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CPNE6O95741 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPNE6O95741 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPNE6O95741 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPNE6O95741 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPNE6O95741 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPNE6O95741 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPNE6O95741 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPNE6O95741 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPNE6O95741 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPNE6O95741 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CPNE6O95741 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPNE6O95741 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPNE6O95741 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPNE6O95741 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPNE6O95741 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPNE6O95741 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPNE6O95741 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPNE6O95741 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPNE6O95741 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPNE6O95741 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPNE6O95741 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPNE6O95741 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPNE6O95741 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPNE6O95741 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPNE6O95741 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPNE6O95741 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPNE6O95741 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPNE6O95741 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPNE6O95741 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPNE6O95741 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPNE6O95741 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPNE6O95741 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPNE6O95741 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CPNE6O95741 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CPNE6O95741 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CPNE6O95741 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPNE6O95741 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPNE6O95741 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPNE6O95741 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPNE6O95741 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPNE6O95741 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPNE6O95741 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPNE6O95741 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPNE6O95741 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPNE6O95741 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPNE6O95741 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPNE6O95741 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPNE6O95741 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPNE6O95741 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPNE6O95741 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPNE6O95741 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPNE6O95741 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CPNE6O95741 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CPNE6O95741 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPNE6O95741 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPNE6O95741 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms