Protein–RNA interactions for Protein: O95718

ESRRB, Steroid hormone receptor ERR2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRBO95718 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ESRRBO95718 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ESRRBO95718 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ESRRBO95718 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ESRRBO95718 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ESRRBO95718 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ESRRBO95718 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ESRRBO95718 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ESRRBO95718 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ESRRBO95718 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ESRRBO95718 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ESRRBO95718 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ESRRBO95718 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ESRRBO95718 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ESRRBO95718 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ESRRBO95718 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ESRRBO95718 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ESRRBO95718 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ESRRBO95718 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ESRRBO95718 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ESRRBO95718 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ESRRBO95718 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ESRRBO95718 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ESRRBO95718 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ESRRBO95718 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ESRRBO95718 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ESRRBO95718 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ESRRBO95718 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ESRRBO95718 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ESRRBO95718 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ESRRBO95718 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ESRRBO95718 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ESRRBO95718 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ESRRBO95718 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ESRRBO95718 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ESRRBO95718 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ESRRBO95718 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ESRRBO95718 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ESRRBO95718 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ESRRBO95718 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ESRRBO95718 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ESRRBO95718 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ESRRBO95718 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ESRRBO95718 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ESRRBO95718 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ESRRBO95718 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ESRRBO95718 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ESRRBO95718 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ESRRBO95718 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ESRRBO95718 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ESRRBO95718 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ESRRBO95718 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ESRRBO95718 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ESRRBO95718 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ESRRBO95718 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ESRRBO95718 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ESRRBO95718 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ESRRBO95718 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ESRRBO95718 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ESRRBO95718 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ESRRBO95718 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ESRRBO95718 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ESRRBO95718 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ESRRBO95718 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ESRRBO95718 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ESRRBO95718 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ESRRBO95718 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ESRRBO95718 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ESRRBO95718 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ESRRBO95718 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ESRRBO95718 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms