Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIX6O95475 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX6O95475 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX6O95475 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SIX6O95475 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX6O95475 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX6O95475 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SIX6O95475 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX6O95475 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX6O95475 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX6O95475 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX6O95475 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIX6O95475 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX6O95475 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX6O95475 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX6O95475 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIX6O95475 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIX6O95475 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX6O95475 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX6O95475 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX6O95475 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX6O95475 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX6O95475 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX6O95475 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIX6O95475 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX6O95475 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX6O95475 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX6O95475 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIX6O95475 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX6O95475 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX6O95475 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX6O95475 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX6O95475 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIX6O95475 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX6O95475 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX6O95475 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX6O95475 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX6O95475 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX6O95475 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIX6O95475 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX6O95475 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX6O95475 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX6O95475 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX6O95475 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX6O95475 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX6O95475 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIX6O95475 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX6O95475 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX6O95475 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX6O95475 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX6O95475 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX6O95475 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIX6O95475 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SIX6O95475 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIX6O95475 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SIX6O95475 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIX6O95475 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIX6O95475 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIX6O95475 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIX6O95475 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIX6O95475 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIX6O95475 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIX6O95475 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SIX6O95475 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIX6O95475 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SIX6O95475 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIX6O95475 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIX6O95475 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIX6O95475 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SIX6O95475 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIX6O95475 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SIX6O95475 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SIX6O95475 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SIX6O95475 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SIX6O95475 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SIX6O95475 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SIX6O95475 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIX6O95475 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIX6O95475 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SIX6O95475 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIX6O95475 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SIX6O95475 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIX6O95475 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIX6O95475 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIX6O95475 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SIX6O95475 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIX6O95475 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIX6O95475 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIX6O95475 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIX6O95475 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIX6O95475 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIX6O95475 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIX6O95475 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SIX6O95475 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIX6O95475 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIX6O95475 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SIX6O95475 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIX6O95475 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIX6O95475 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SIX6O95475 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms