Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMC2O95347 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMC2O95347 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMC2O95347 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMC2O95347 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMC2O95347 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMC2O95347 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMC2O95347 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMC2O95347 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMC2O95347 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SMC2O95347 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMC2O95347 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMC2O95347 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMC2O95347 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMC2O95347 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMC2O95347 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMC2O95347 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMC2O95347 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMC2O95347 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMC2O95347 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMC2O95347 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMC2O95347 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMC2O95347 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMC2O95347 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMC2O95347 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMC2O95347 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMC2O95347 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMC2O95347 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMC2O95347 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMC2O95347 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMC2O95347 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC2O95347 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC2O95347 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC2O95347 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC2O95347 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SMC2O95347 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMC2O95347 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMC2O95347 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMC2O95347 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC2O95347 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC2O95347 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC2O95347 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC2O95347 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC2O95347 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC2O95347 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC2O95347 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMC2O95347 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMC2O95347 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMC2O95347 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMC2O95347 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SMC2O95347 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMC2O95347 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SMC2O95347 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMC2O95347 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMC2O95347 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMC2O95347 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMC2O95347 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC2O95347 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMC2O95347 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMC2O95347 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMC2O95347 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMC2O95347 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SMC2O95347 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMC2O95347 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMC2O95347 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMC2O95347 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMC2O95347 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMC2O95347 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC2O95347 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC2O95347 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC2O95347 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC2O95347 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC2O95347 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMC2O95347 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMC2O95347 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMC2O95347 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMC2O95347 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMC2O95347 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMC2O95347 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMC2O95347 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMC2O95347 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMC2O95347 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMC2O95347 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC2O95347 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC2O95347 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SMC2O95347 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC2O95347 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC2O95347 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC2O95347 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC2O95347 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC2O95347 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC2O95347 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC2O95347 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC2O95347 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC2O95347 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMC2O95347 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMC2O95347 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SMC2O95347 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMC2O95347 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SMC2O95347 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms