Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG12O94817 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG12O94817 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG12O94817 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG12O94817 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG12O94817 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG12O94817 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG12O94817 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG12O94817 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG12O94817 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG12O94817 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG12O94817 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG12O94817 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG12O94817 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG12O94817 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG12O94817 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG12O94817 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG12O94817 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG12O94817 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG12O94817 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG12O94817 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG12O94817 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG12O94817 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG12O94817 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG12O94817 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG12O94817 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG12O94817 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG12O94817 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG12O94817 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG12O94817 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG12O94817 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG12O94817 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG12O94817 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG12O94817 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG12O94817 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG12O94817 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG12O94817 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG12O94817 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG12O94817 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG12O94817 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG12O94817 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG12O94817 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG12O94817 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG12O94817 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG12O94817 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG12O94817 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG12O94817 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG12O94817 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG12O94817 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG12O94817 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG12O94817 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG12O94817 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG12O94817 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG12O94817 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG12O94817 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG12O94817 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG12O94817 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG12O94817 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG12O94817 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG12O94817 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG12O94817 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG12O94817 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG12O94817 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG12O94817 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG12O94817 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG12O94817 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG12O94817 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG12O94817 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG12O94817 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG12O94817 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG12O94817 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG12O94817 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG12O94817 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG12O94817 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG12O94817 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG12O94817 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG12O94817 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG12O94817 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG12O94817 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG12O94817 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG12O94817 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG12O94817 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG12O94817 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG12O94817 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG12O94817 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG12O94817 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG12O94817 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG12O94817 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG12O94817 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG12O94817 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG12O94817 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG12O94817 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG12O94817 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG12O94817 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG12O94817 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG12O94817 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG12O94817 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG12O94817 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG12O94817 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATG12O94817 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms