Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Setdb1O88974 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Setdb1O88974 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Setdb1O88974 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Setdb1O88974 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Setdb1O88974 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Setdb1O88974 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Setdb1O88974 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Setdb1O88974 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Setdb1O88974 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Setdb1O88974 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Setdb1O88974 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Setdb1O88974 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Setdb1O88974 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Setdb1O88974 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Setdb1O88974 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Setdb1O88974 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Setdb1O88974 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Setdb1O88974 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Setdb1O88974 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Setdb1O88974 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Setdb1O88974 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Setdb1O88974 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Setdb1O88974 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Setdb1O88974 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Setdb1O88974 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Setdb1O88974 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Setdb1O88974 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Setdb1O88974 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Setdb1O88974 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Setdb1O88974 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Setdb1O88974 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Setdb1O88974 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Setdb1O88974 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Setdb1O88974 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Setdb1O88974 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Setdb1O88974 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Setdb1O88974 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Setdb1O88974 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Setdb1O88974 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Setdb1O88974 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Setdb1O88974 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Setdb1O88974 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Setdb1O88974 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Setdb1O88974 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Setdb1O88974 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Setdb1O88974 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Setdb1O88974 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Setdb1O88974 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Setdb1O88974 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Setdb1O88974 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Setdb1O88974 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Setdb1O88974 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Setdb1O88974 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Setdb1O88974 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Setdb1O88974 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Setdb1O88974 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Setdb1O88974 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Setdb1O88974 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Setdb1O88974 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Setdb1O88974 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Setdb1O88974 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Setdb1O88974 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Setdb1O88974 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Setdb1O88974 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Setdb1O88974 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Setdb1O88974 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Setdb1O88974 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Setdb1O88974 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Setdb1O88974 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Setdb1O88974 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Setdb1O88974 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Setdb1O88974 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Setdb1O88974 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Setdb1O88974 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Setdb1O88974 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Setdb1O88974 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Setdb1O88974 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Setdb1O88974 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Setdb1O88974 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Setdb1O88974 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Setdb1O88974 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Setdb1O88974 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Setdb1O88974 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Setdb1O88974 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Setdb1O88974 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Setdb1O88974 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Setdb1O88974 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Setdb1O88974 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Setdb1O88974 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Setdb1O88974 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Setdb1O88974 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Setdb1O88974 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Setdb1O88974 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Setdb1O88974 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Setdb1O88974 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Setdb1O88974 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Setdb1O88974 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Setdb1O88974 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Setdb1O88974 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms