Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcn2O88968 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcn2O88968 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcn2O88968 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcn2O88968 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcn2O88968 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcn2O88968 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcn2O88968 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcn2O88968 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcn2O88968 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcn2O88968 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tcn2O88968 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcn2O88968 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcn2O88968 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcn2O88968 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcn2O88968 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcn2O88968 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcn2O88968 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcn2O88968 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcn2O88968 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcn2O88968 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcn2O88968 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcn2O88968 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcn2O88968 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcn2O88968 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcn2O88968 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcn2O88968 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcn2O88968 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcn2O88968 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcn2O88968 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcn2O88968 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcn2O88968 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tcn2O88968 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcn2O88968 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcn2O88968 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcn2O88968 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcn2O88968 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcn2O88968 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcn2O88968 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcn2O88968 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcn2O88968 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcn2O88968 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcn2O88968 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcn2O88968 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcn2O88968 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcn2O88968 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcn2O88968 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcn2O88968 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcn2O88968 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcn2O88968 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcn2O88968 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcn2O88968 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcn2O88968 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcn2O88968 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcn2O88968 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcn2O88968 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcn2O88968 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcn2O88968 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcn2O88968 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcn2O88968 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcn2O88968 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcn2O88968 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcn2O88968 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcn2O88968 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcn2O88968 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcn2O88968 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcn2O88968 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcn2O88968 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcn2O88968 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcn2O88968 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcn2O88968 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcn2O88968 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcn2O88968 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tcn2O88968 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcn2O88968 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcn2O88968 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcn2O88968 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcn2O88968 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcn2O88968 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcn2O88968 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcn2O88968 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcn2O88968 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcn2O88968 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcn2O88968 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcn2O88968 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcn2O88968 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcn2O88968 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcn2O88968 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcn2O88968 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcn2O88968 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcn2O88968 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcn2O88968 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcn2O88968 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcn2O88968 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcn2O88968 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcn2O88968 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcn2O88968 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcn2O88968 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcn2O88968 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Tcn2O88968 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms