Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col5a1O88207 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Col5a1O88207 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col5a1O88207 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col5a1O88207 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col5a1O88207 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col5a1O88207 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col5a1O88207 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col5a1O88207 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col5a1O88207 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Col5a1O88207 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col5a1O88207 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col5a1O88207 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col5a1O88207 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col5a1O88207 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col5a1O88207 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col5a1O88207 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col5a1O88207 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col5a1O88207 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Col5a1O88207 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Col5a1O88207 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col5a1O88207 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col5a1O88207 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col5a1O88207 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col5a1O88207 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Col5a1O88207 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Col5a1O88207 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col5a1O88207 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col5a1O88207 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col5a1O88207 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Col5a1O88207 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col5a1O88207 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Col5a1O88207 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Col5a1O88207 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col5a1O88207 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Col5a1O88207 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Col5a1O88207 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col5a1O88207 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col5a1O88207 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Col5a1O88207 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Col5a1O88207 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col5a1O88207 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col5a1O88207 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col5a1O88207 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col5a1O88207 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col5a1O88207 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col5a1O88207 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col5a1O88207 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col5a1O88207 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Col5a1O88207 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Col5a1O88207 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col5a1O88207 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col5a1O88207 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col5a1O88207 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col5a1O88207 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col5a1O88207 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col5a1O88207 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col5a1O88207 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col5a1O88207 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Col5a1O88207 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col5a1O88207 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col5a1O88207 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col5a1O88207 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Col5a1O88207 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col5a1O88207 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col5a1O88207 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col5a1O88207 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col5a1O88207 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Col5a1O88207 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col5a1O88207 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col5a1O88207 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col5a1O88207 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col5a1O88207 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Col5a1O88207 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col5a1O88207 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col5a1O88207 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Col5a1O88207 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col5a1O88207 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col5a1O88207 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col5a1O88207 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col5a1O88207 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col5a1O88207 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col5a1O88207 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col5a1O88207 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col5a1O88207 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col5a1O88207 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col5a1O88207 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col5a1O88207 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col5a1O88207 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col5a1O88207 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col5a1O88207 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col5a1O88207 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col5a1O88207 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col5a1O88207 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Col5a1O88207 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col5a1O88207 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col5a1O88207 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Col5a1O88207 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col5a1O88207 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col5a1O88207 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms