Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAPN15O75808 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAPN15O75808 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAPN15O75808 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CAPN15O75808 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
CAPN15O75808 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CAPN15O75808 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CAPN15O75808 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAPN15O75808 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAPN15O75808 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAPN15O75808 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAPN15O75808 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CAPN15O75808 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CAPN15O75808 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CAPN15O75808 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CAPN15O75808 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CAPN15O75808 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CAPN15O75808 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CAPN15O75808 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CAPN15O75808 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CAPN15O75808 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CAPN15O75808 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CAPN15O75808 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CAPN15O75808 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CAPN15O75808 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CAPN15O75808 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CAPN15O75808 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CAPN15O75808 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CAPN15O75808 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CAPN15O75808 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CAPN15O75808 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CAPN15O75808 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CAPN15O75808 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CAPN15O75808 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAPN15O75808 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAPN15O75808 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAPN15O75808 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CAPN15O75808 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAPN15O75808 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAPN15O75808 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAPN15O75808 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAPN15O75808 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CAPN15O75808 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAPN15O75808 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CAPN15O75808 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAPN15O75808 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAPN15O75808 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAPN15O75808 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAPN15O75808 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAPN15O75808 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAPN15O75808 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAPN15O75808 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CAPN15O75808 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CAPN15O75808 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CAPN15O75808 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CAPN15O75808 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CAPN15O75808 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CAPN15O75808 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CAPN15O75808 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CAPN15O75808 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAPN15O75808 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAPN15O75808 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAPN15O75808 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAPN15O75808 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAPN15O75808 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAPN15O75808 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CAPN15O75808 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CAPN15O75808 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CAPN15O75808 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CAPN15O75808 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAPN15O75808 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAPN15O75808 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAPN15O75808 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAPN15O75808 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAPN15O75808 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAPN15O75808 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAPN15O75808 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAPN15O75808 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAPN15O75808 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CAPN15O75808 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CAPN15O75808 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAPN15O75808 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAPN15O75808 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAPN15O75808 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAPN15O75808 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CAPN15O75808 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAPN15O75808 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAPN15O75808 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAPN15O75808 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAPN15O75808 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAPN15O75808 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CAPN15O75808 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAPN15O75808 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAPN15O75808 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CAPN15O75808 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAPN15O75808 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CAPN15O75808 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CAPN15O75808 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CAPN15O75808 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CAPN15O75808 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231 ms