Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKAP2O75563 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKAP2O75563 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKAP2O75563 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKAP2O75563 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKAP2O75563 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKAP2O75563 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKAP2O75563 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKAP2O75563 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKAP2O75563 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKAP2O75563 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKAP2O75563 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKAP2O75563 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKAP2O75563 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKAP2O75563 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKAP2O75563 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKAP2O75563 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKAP2O75563 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKAP2O75563 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKAP2O75563 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKAP2O75563 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKAP2O75563 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKAP2O75563 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKAP2O75563 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKAP2O75563 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKAP2O75563 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKAP2O75563 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKAP2O75563 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKAP2O75563 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKAP2O75563 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKAP2O75563 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKAP2O75563 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKAP2O75563 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKAP2O75563 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKAP2O75563 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKAP2O75563 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKAP2O75563 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKAP2O75563 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKAP2O75563 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SKAP2O75563 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SKAP2O75563 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms