Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMPCBO75439 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMPCBO75439 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMPCBO75439 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMPCBO75439 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PMPCBO75439 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMPCBO75439 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PMPCBO75439 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PMPCBO75439 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PMPCBO75439 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PMPCBO75439 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PMPCBO75439 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PMPCBO75439 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PMPCBO75439 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PMPCBO75439 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PMPCBO75439 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PMPCBO75439 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PMPCBO75439 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PMPCBO75439 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PMPCBO75439 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PMPCBO75439 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PMPCBO75439 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PMPCBO75439 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PMPCBO75439 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PMPCBO75439 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PMPCBO75439 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PMPCBO75439 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PMPCBO75439 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PMPCBO75439 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PMPCBO75439 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PMPCBO75439 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PMPCBO75439 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms