Protein–RNA interactions for Protein: O75417

POLQ, DNA polymerase theta, humanhuman

Predictions only

Length 2,590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLQO75417 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLQO75417 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLQO75417 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLQO75417 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLQO75417 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLQO75417 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLQO75417 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLQO75417 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLQO75417 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLQO75417 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLQO75417 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLQO75417 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLQO75417 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLQO75417 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLQO75417 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLQO75417 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLQO75417 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLQO75417 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLQO75417 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLQO75417 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLQO75417 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLQO75417 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLQO75417 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLQO75417 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLQO75417 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLQO75417 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLQO75417 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLQO75417 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLQO75417 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLQO75417 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLQO75417 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLQO75417 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLQO75417 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLQO75417 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLQO75417 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLQO75417 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLQO75417 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLQO75417 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLQO75417 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLQO75417 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLQO75417 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLQO75417 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLQO75417 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLQO75417 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLQO75417 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLQO75417 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLQO75417 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLQO75417 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLQO75417 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLQO75417 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLQO75417 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLQO75417 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLQO75417 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLQO75417 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLQO75417 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLQO75417 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLQO75417 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLQO75417 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLQO75417 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLQO75417 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLQO75417 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLQO75417 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLQO75417 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLQO75417 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLQO75417 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLQO75417 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLQO75417 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLQO75417 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLQO75417 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLQO75417 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLQO75417 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLQO75417 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLQO75417 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
POLQO75417 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLQO75417 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLQO75417 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLQO75417 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
POLQO75417 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLQO75417 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLQO75417 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLQO75417 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLQO75417 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLQO75417 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLQO75417 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLQO75417 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLQO75417 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLQO75417 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLQO75417 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
POLQO75417 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
POLQO75417 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLQO75417 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POLQO75417 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLQO75417 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLQO75417 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLQO75417 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLQO75417 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
POLQO75417 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLQO75417 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLQO75417 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLQO75417 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms