Protein–RNA interactions for Protein: O75208

COQ9, Ubiquinone biosynthesis protein COQ9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ9O75208 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COQ9O75208 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COQ9O75208 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COQ9O75208 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COQ9O75208 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COQ9O75208 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COQ9O75208 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COQ9O75208 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COQ9O75208 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COQ9O75208 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COQ9O75208 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COQ9O75208 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COQ9O75208 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COQ9O75208 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COQ9O75208 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COQ9O75208 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COQ9O75208 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COQ9O75208 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COQ9O75208 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COQ9O75208 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COQ9O75208 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COQ9O75208 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COQ9O75208 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COQ9O75208 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COQ9O75208 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COQ9O75208 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COQ9O75208 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COQ9O75208 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COQ9O75208 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COQ9O75208 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COQ9O75208 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COQ9O75208 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COQ9O75208 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COQ9O75208 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COQ9O75208 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COQ9O75208 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COQ9O75208 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COQ9O75208 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COQ9O75208 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COQ9O75208 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COQ9O75208 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COQ9O75208 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COQ9O75208 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COQ9O75208 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COQ9O75208 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COQ9O75208 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COQ9O75208 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COQ9O75208 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COQ9O75208 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COQ9O75208 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COQ9O75208 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COQ9O75208 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COQ9O75208 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COQ9O75208 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COQ9O75208 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COQ9O75208 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COQ9O75208 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COQ9O75208 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COQ9O75208 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COQ9O75208 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COQ9O75208 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COQ9O75208 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COQ9O75208 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COQ9O75208 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COQ9O75208 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COQ9O75208 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COQ9O75208 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COQ9O75208 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COQ9O75208 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COQ9O75208 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COQ9O75208 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
COQ9O75208 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COQ9O75208 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COQ9O75208 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COQ9O75208 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COQ9O75208 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COQ9O75208 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COQ9O75208 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COQ9O75208 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COQ9O75208 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COQ9O75208 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COQ9O75208 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COQ9O75208 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COQ9O75208 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COQ9O75208 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COQ9O75208 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COQ9O75208 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COQ9O75208 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COQ9O75208 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COQ9O75208 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COQ9O75208 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COQ9O75208 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COQ9O75208 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COQ9O75208 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COQ9O75208 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COQ9O75208 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COQ9O75208 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COQ9O75208 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COQ9O75208 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COQ9O75208 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms