Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SS18L1O75177 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SS18L1O75177 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SS18L1O75177 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SS18L1O75177 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SS18L1O75177 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SS18L1O75177 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SS18L1O75177 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SS18L1O75177 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SS18L1O75177 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SS18L1O75177 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SS18L1O75177 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SS18L1O75177 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SS18L1O75177 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SS18L1O75177 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SS18L1O75177 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SS18L1O75177 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SS18L1O75177 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SS18L1O75177 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SS18L1O75177 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SS18L1O75177 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SS18L1O75177 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SS18L1O75177 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SS18L1O75177 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SS18L1O75177 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SS18L1O75177 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SS18L1O75177 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SS18L1O75177 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SS18L1O75177 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SS18L1O75177 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SS18L1O75177 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SS18L1O75177 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SS18L1O75177 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SS18L1O75177 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SS18L1O75177 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SS18L1O75177 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SS18L1O75177 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SS18L1O75177 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SS18L1O75177 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SS18L1O75177 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SS18L1O75177 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SS18L1O75177 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SS18L1O75177 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SS18L1O75177 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SS18L1O75177 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SS18L1O75177 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SS18L1O75177 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SS18L1O75177 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SS18L1O75177 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SS18L1O75177 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SS18L1O75177 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SS18L1O75177 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SS18L1O75177 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SS18L1O75177 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SS18L1O75177 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SS18L1O75177 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SS18L1O75177 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SS18L1O75177 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms