Protein–RNA interactions for Protein: O75096

LRP4, Low-density lipoprotein receptor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP4O75096 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRP4O75096 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRP4O75096 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP4O75096 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRP4O75096 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP4O75096 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP4O75096 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRP4O75096 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP4O75096 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP4O75096 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP4O75096 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP4O75096 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP4O75096 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP4O75096 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP4O75096 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP4O75096 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP4O75096 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP4O75096 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP4O75096 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP4O75096 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP4O75096 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP4O75096 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP4O75096 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP4O75096 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP4O75096 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP4O75096 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP4O75096 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP4O75096 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP4O75096 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP4O75096 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP4O75096 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP4O75096 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP4O75096 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP4O75096 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP4O75096 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP4O75096 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP4O75096 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP4O75096 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP4O75096 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP4O75096 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP4O75096 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP4O75096 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRP4O75096 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRP4O75096 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRP4O75096 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRP4O75096 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRP4O75096 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRP4O75096 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRP4O75096 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRP4O75096 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRP4O75096 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRP4O75096 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRP4O75096 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRP4O75096 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRP4O75096 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRP4O75096 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRP4O75096 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRP4O75096 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRP4O75096 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRP4O75096 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRP4O75096 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRP4O75096 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRP4O75096 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRP4O75096 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRP4O75096 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRP4O75096 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRP4O75096 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRP4O75096 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRP4O75096 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRP4O75096 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRP4O75096 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRP4O75096 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRP4O75096 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRP4O75096 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRP4O75096 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRP4O75096 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRP4O75096 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP4O75096 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRP4O75096 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP4O75096 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP4O75096 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP4O75096 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP4O75096 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP4O75096 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRP4O75096 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRP4O75096 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRP4O75096 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRP4O75096 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRP4O75096 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRP4O75096 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRP4O75096 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRP4O75096 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
LRP4O75096 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRP4O75096 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRP4O75096 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRP4O75096 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRP4O75096 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRP4O75096 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRP4O75096 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRP4O75096 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms