Protein–RNA interactions for Protein: O70238

Rhox6, Homeobox protein PSX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox6O70238 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhox6O70238 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhox6O70238 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhox6O70238 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhox6O70238 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhox6O70238 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rhox6O70238 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rhox6O70238 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rhox6O70238 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhox6O70238 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhox6O70238 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhox6O70238 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhox6O70238 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox6O70238 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox6O70238 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox6O70238 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox6O70238 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox6O70238 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox6O70238 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox6O70238 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox6O70238 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox6O70238 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox6O70238 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox6O70238 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox6O70238 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox6O70238 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox6O70238 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox6O70238 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rhox6O70238 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhox6O70238 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhox6O70238 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhox6O70238 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhox6O70238 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox6O70238 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox6O70238 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox6O70238 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox6O70238 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox6O70238 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox6O70238 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox6O70238 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox6O70238 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox6O70238 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox6O70238 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox6O70238 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox6O70238 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox6O70238 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox6O70238 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox6O70238 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox6O70238 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox6O70238 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox6O70238 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox6O70238 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox6O70238 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox6O70238 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox6O70238 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox6O70238 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox6O70238 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox6O70238 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox6O70238 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox6O70238 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox6O70238 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox6O70238 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox6O70238 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox6O70238 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox6O70238 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox6O70238 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox6O70238 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox6O70238 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox6O70238 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox6O70238 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox6O70238 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox6O70238 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox6O70238 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox6O70238 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox6O70238 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox6O70238 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox6O70238 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox6O70238 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox6O70238 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox6O70238 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox6O70238 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox6O70238 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox6O70238 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox6O70238 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox6O70238 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox6O70238 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox6O70238 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox6O70238 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox6O70238 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox6O70238 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox6O70238 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox6O70238 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox6O70238 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox6O70238 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox6O70238 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox6O70238 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox6O70238 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox6O70238 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox6O70238 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox6O70238 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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