Protein–RNA interactions for Protein: O70172

Pip4k2a, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4k2aO70172 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pip4k2aO70172 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pip4k2aO70172 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pip4k2aO70172 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pip4k2aO70172 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pip4k2aO70172 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pip4k2aO70172 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pip4k2aO70172 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pip4k2aO70172 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pip4k2aO70172 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pip4k2aO70172 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pip4k2aO70172 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pip4k2aO70172 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pip4k2aO70172 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pip4k2aO70172 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pip4k2aO70172 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pip4k2aO70172 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pip4k2aO70172 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pip4k2aO70172 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pip4k2aO70172 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pip4k2aO70172 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pip4k2aO70172 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pip4k2aO70172 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pip4k2aO70172 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pip4k2aO70172 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pip4k2aO70172 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Pip4k2aO70172 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pip4k2aO70172 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pip4k2aO70172 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pip4k2aO70172 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pip4k2aO70172 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pip4k2aO70172 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Pip4k2aO70172 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pip4k2aO70172 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pip4k2aO70172 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pip4k2aO70172 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pip4k2aO70172 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pip4k2aO70172 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pip4k2aO70172 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pip4k2aO70172 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pip4k2aO70172 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pip4k2aO70172 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pip4k2aO70172 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pip4k2aO70172 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pip4k2aO70172 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pip4k2aO70172 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pip4k2aO70172 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pip4k2aO70172 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pip4k2aO70172 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pip4k2aO70172 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pip4k2aO70172 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pip4k2aO70172 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pip4k2aO70172 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pip4k2aO70172 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pip4k2aO70172 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Pip4k2aO70172 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pip4k2aO70172 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pip4k2aO70172 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Pip4k2aO70172 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pip4k2aO70172 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pip4k2aO70172 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pip4k2aO70172 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pip4k2aO70172 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pip4k2aO70172 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pip4k2aO70172 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pip4k2aO70172 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Pip4k2aO70172 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pip4k2aO70172 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pip4k2aO70172 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Pip4k2aO70172 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Pip4k2aO70172 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pip4k2aO70172 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pip4k2aO70172 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pip4k2aO70172 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pip4k2aO70172 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pip4k2aO70172 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pip4k2aO70172 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pip4k2aO70172 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pip4k2aO70172 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pip4k2aO70172 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pip4k2aO70172 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pip4k2aO70172 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pip4k2aO70172 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pip4k2aO70172 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pip4k2aO70172 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pip4k2aO70172 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pip4k2aO70172 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pip4k2aO70172 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pip4k2aO70172 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pip4k2aO70172 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pip4k2aO70172 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pip4k2aO70172 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pip4k2aO70172 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pip4k2aO70172 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pip4k2aO70172 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pip4k2aO70172 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pip4k2aO70172 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pip4k2aO70172 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pip4k2aO70172 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pip4k2aO70172 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.1 ms