Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SORBS3O60504 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SORBS3O60504 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SORBS3O60504 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SORBS3O60504 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SORBS3O60504 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SORBS3O60504 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SORBS3O60504 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SORBS3O60504 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SORBS3O60504 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SORBS3O60504 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SORBS3O60504 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SORBS3O60504 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SORBS3O60504 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SORBS3O60504 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SORBS3O60504 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SORBS3O60504 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SORBS3O60504 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SORBS3O60504 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SORBS3O60504 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SORBS3O60504 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SORBS3O60504 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SORBS3O60504 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SORBS3O60504 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SORBS3O60504 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SORBS3O60504 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SORBS3O60504 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SORBS3O60504 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SORBS3O60504 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SORBS3O60504 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SORBS3O60504 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SORBS3O60504 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SORBS3O60504 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SORBS3O60504 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SORBS3O60504 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SORBS3O60504 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SORBS3O60504 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SORBS3O60504 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SORBS3O60504 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SORBS3O60504 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SORBS3O60504 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SORBS3O60504 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SORBS3O60504 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SORBS3O60504 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SORBS3O60504 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SORBS3O60504 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SORBS3O60504 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SORBS3O60504 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SORBS3O60504 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SORBS3O60504 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SORBS3O60504 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SORBS3O60504 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SORBS3O60504 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SORBS3O60504 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SORBS3O60504 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SORBS3O60504 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SORBS3O60504 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SORBS3O60504 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SORBS3O60504 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SORBS3O60504 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SORBS3O60504 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SORBS3O60504 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SORBS3O60504 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SORBS3O60504 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SORBS3O60504 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SORBS3O60504 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SORBS3O60504 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SORBS3O60504 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SORBS3O60504 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SORBS3O60504 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SORBS3O60504 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SORBS3O60504 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms