Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP8B3O60423 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP8B3O60423 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP8B3O60423 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP8B3O60423 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP8B3O60423 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP8B3O60423 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP8B3O60423 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP8B3O60423 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP8B3O60423 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP8B3O60423 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP8B3O60423 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP8B3O60423 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP8B3O60423 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP8B3O60423 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP8B3O60423 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP8B3O60423 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP8B3O60423 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP8B3O60423 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP8B3O60423 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP8B3O60423 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP8B3O60423 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP8B3O60423 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP8B3O60423 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP8B3O60423 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP8B3O60423 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP8B3O60423 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP8B3O60423 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP8B3O60423 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP8B3O60423 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP8B3O60423 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP8B3O60423 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP8B3O60423 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP8B3O60423 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP8B3O60423 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP8B3O60423 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP8B3O60423 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP8B3O60423 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP8B3O60423 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP8B3O60423 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP8B3O60423 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP8B3O60423 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP8B3O60423 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP8B3O60423 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP8B3O60423 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP8B3O60423 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP8B3O60423 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
ATP8B3O60423 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP8B3O60423 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP8B3O60423 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP8B3O60423 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP8B3O60423 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP8B3O60423 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP8B3O60423 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP8B3O60423 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP8B3O60423 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP8B3O60423 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP8B3O60423 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP8B3O60423 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP8B3O60423 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP8B3O60423 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP8B3O60423 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP8B3O60423 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP8B3O60423 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP8B3O60423 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATP8B3O60423 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP8B3O60423 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATP8B3O60423 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP8B3O60423 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP8B3O60423 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP8B3O60423 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP8B3O60423 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP8B3O60423 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP8B3O60423 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
ATP8B3O60423 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP8B3O60423 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP8B3O60423 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP8B3O60423 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP8B3O60423 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP8B3O60423 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP8B3O60423 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP8B3O60423 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP8B3O60423 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP8B3O60423 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP8B3O60423 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP8B3O60423 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP8B3O60423 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP8B3O60423 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP8B3O60423 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP8B3O60423 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP8B3O60423 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP8B3O60423 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP8B3O60423 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP8B3O60423 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP8B3O60423 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP8B3O60423 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP8B3O60423 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP8B3O60423 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP8B3O60423 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP8B3O60423 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms