Protein–RNA interactions for Protein: O60383

GDF9, Growth/differentiation factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF9O60383 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF9O60383 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDF9O60383 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF9O60383 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF9O60383 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF9O60383 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF9O60383 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF9O60383 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF9O60383 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF9O60383 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF9O60383 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF9O60383 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF9O60383 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF9O60383 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF9O60383 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF9O60383 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF9O60383 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
GDF9O60383 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF9O60383 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF9O60383 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF9O60383 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDF9O60383 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDF9O60383 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF9O60383 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF9O60383 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF9O60383 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF9O60383 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF9O60383 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF9O60383 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF9O60383 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF9O60383 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF9O60383 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF9O60383 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF9O60383 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF9O60383 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDF9O60383 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDF9O60383 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDF9O60383 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF9O60383 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDF9O60383 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GDF9O60383 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDF9O60383 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDF9O60383 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDF9O60383 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GDF9O60383 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDF9O60383 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF9O60383 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF9O60383 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF9O60383 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF9O60383 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF9O60383 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF9O60383 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF9O60383 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDF9O60383 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF9O60383 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF9O60383 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF9O60383 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDF9O60383 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDF9O60383 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GDF9O60383 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF9O60383 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF9O60383 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF9O60383 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF9O60383 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF9O60383 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF9O60383 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF9O60383 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF9O60383 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDF9O60383 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF9O60383 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF9O60383 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF9O60383 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDF9O60383 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF9O60383 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF9O60383 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF9O60383 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF9O60383 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF9O60383 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF9O60383 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF9O60383 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF9O60383 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF9O60383 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF9O60383 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF9O60383 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF9O60383 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF9O60383 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF9O60383 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF9O60383 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF9O60383 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF9O60383 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF9O60383 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF9O60383 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF9O60383 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF9O60383 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF9O60383 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF9O60383 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF9O60383 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF9O60383 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF9O60383 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF9O60383 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.5 ms