Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3BP5O60239 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3BP5O60239 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3BP5O60239 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3BP5O60239 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3BP5O60239 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3BP5O60239 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3BP5O60239 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3BP5O60239 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3BP5O60239 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3BP5O60239 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3BP5O60239 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3BP5O60239 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3BP5O60239 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3BP5O60239 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3BP5O60239 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3BP5O60239 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SH3BP5O60239 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3BP5O60239 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3BP5O60239 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3BP5O60239 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3BP5O60239 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3BP5O60239 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3BP5O60239 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3BP5O60239 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3BP5O60239 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3BP5O60239 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3BP5O60239 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3BP5O60239 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3BP5O60239 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3BP5O60239 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3BP5O60239 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3BP5O60239 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3BP5O60239 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3BP5O60239 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3BP5O60239 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3BP5O60239 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3BP5O60239 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3BP5O60239 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3BP5O60239 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3BP5O60239 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3BP5O60239 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3BP5O60239 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3BP5O60239 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3BP5O60239 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3BP5O60239 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3BP5O60239 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3BP5O60239 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3BP5O60239 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3BP5O60239 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3BP5O60239 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3BP5O60239 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3BP5O60239 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3BP5O60239 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3BP5O60239 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3BP5O60239 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3BP5O60239 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SH3BP5O60239 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3BP5O60239 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3BP5O60239 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3BP5O60239 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3BP5O60239 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3BP5O60239 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3BP5O60239 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3BP5O60239 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3BP5O60239 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3BP5O60239 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3BP5O60239 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3BP5O60239 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3BP5O60239 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3BP5O60239 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3BP5O60239 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3BP5O60239 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3BP5O60239 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3BP5O60239 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH3BP5O60239 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3BP5O60239 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3BP5O60239 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3BP5O60239 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3BP5O60239 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3BP5O60239 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3BP5O60239 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3BP5O60239 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3BP5O60239 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3BP5O60239 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3BP5O60239 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3BP5O60239 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3BP5O60239 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3BP5O60239 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3BP5O60239 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3BP5O60239 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3BP5O60239 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3BP5O60239 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3BP5O60239 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3BP5O60239 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3BP5O60239 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3BP5O60239 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3BP5O60239 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3BP5O60239 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3BP5O60239 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
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