Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SlkO54988 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SlkO54988 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SlkO54988 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SlkO54988 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SlkO54988 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SlkO54988 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SlkO54988 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SlkO54988 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SlkO54988 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SlkO54988 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SlkO54988 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SlkO54988 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SlkO54988 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SlkO54988 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SlkO54988 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SlkO54988 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SlkO54988 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SlkO54988 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SlkO54988 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SlkO54988 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SlkO54988 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SlkO54988 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SlkO54988 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SlkO54988 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SlkO54988 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SlkO54988 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SlkO54988 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SlkO54988 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SlkO54988 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SlkO54988 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SlkO54988 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SlkO54988 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SlkO54988 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SlkO54988 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SlkO54988 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SlkO54988 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SlkO54988 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SlkO54988 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SlkO54988 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SlkO54988 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SlkO54988 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SlkO54988 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SlkO54988 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SlkO54988 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SlkO54988 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SlkO54988 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SlkO54988 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SlkO54988 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SlkO54988 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SlkO54988 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SlkO54988 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SlkO54988 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SlkO54988 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SlkO54988 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SlkO54988 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SlkO54988 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SlkO54988 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SlkO54988 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SlkO54988 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SlkO54988 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SlkO54988 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SlkO54988 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SlkO54988 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SlkO54988 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SlkO54988 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SlkO54988 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SlkO54988 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SlkO54988 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SlkO54988 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SlkO54988 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SlkO54988 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SlkO54988 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SlkO54988 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SlkO54988 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SlkO54988 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SlkO54988 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SlkO54988 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SlkO54988 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SlkO54988 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SlkO54988 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SlkO54988 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SlkO54988 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SlkO54988 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SlkO54988 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SlkO54988 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SlkO54988 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SlkO54988 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SlkO54988 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SlkO54988 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SlkO54988 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SlkO54988 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SlkO54988 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SlkO54988 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SlkO54988 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SlkO54988 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SlkO54988 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SlkO54988 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SlkO54988 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SlkO54988 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms