Protein–RNA interactions for Protein: O54962

Banf1, Barrier-to-autointegration factor, mousemouse

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Banf1O54962 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Banf1O54962 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Banf1O54962 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Banf1O54962 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Banf1O54962 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Banf1O54962 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Banf1O54962 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Banf1O54962 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Banf1O54962 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Banf1O54962 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Banf1O54962 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Banf1O54962 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Banf1O54962 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Banf1O54962 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Banf1O54962 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Banf1O54962 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Banf1O54962 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Banf1O54962 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Banf1O54962 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Banf1O54962 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Banf1O54962 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Banf1O54962 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Banf1O54962 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Banf1O54962 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Banf1O54962 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Banf1O54962 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Banf1O54962 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Banf1O54962 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Banf1O54962 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Banf1O54962 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Banf1O54962 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Banf1O54962 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Banf1O54962 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Banf1O54962 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Banf1O54962 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Banf1O54962 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Banf1O54962 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Banf1O54962 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Banf1O54962 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Banf1O54962 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Banf1O54962 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Banf1O54962 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Banf1O54962 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Banf1O54962 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Banf1O54962 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Banf1O54962 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Banf1O54962 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Banf1O54962 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Banf1O54962 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Banf1O54962 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Banf1O54962 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Banf1O54962 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Banf1O54962 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Banf1O54962 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Banf1O54962 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Banf1O54962 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Banf1O54962 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Banf1O54962 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Banf1O54962 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Banf1O54962 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Banf1O54962 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Banf1O54962 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Banf1O54962 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Banf1O54962 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Banf1O54962 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Banf1O54962 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Banf1O54962 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Banf1O54962 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Banf1O54962 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Banf1O54962 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Banf1O54962 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Banf1O54962 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Banf1O54962 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Banf1O54962 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Banf1O54962 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Banf1O54962 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Banf1O54962 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Banf1O54962 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Banf1O54962 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Banf1O54962 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Banf1O54962 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Banf1O54962 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Banf1O54962 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Banf1O54962 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Banf1O54962 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Banf1O54962 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Banf1O54962 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Banf1O54962 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Banf1O54962 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Banf1O54962 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Banf1O54962 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Banf1O54962 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Banf1O54962 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Banf1O54962 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Banf1O54962 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Banf1O54962 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Banf1O54962 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Banf1O54962 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Banf1O54962 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Banf1O54962 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms