Protein–RNA interactions for Protein: O54931

Akap2, A-kinase anchor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap2O54931 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Akap2O54931 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Akap2O54931 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Akap2O54931 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Akap2O54931 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Akap2O54931 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Akap2O54931 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Akap2O54931 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Akap2O54931 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Akap2O54931 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Akap2O54931 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Akap2O54931 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Akap2O54931 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Akap2O54931 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Akap2O54931 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Akap2O54931 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Akap2O54931 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Akap2O54931 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Akap2O54931 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Akap2O54931 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Akap2O54931 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Akap2O54931 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Akap2O54931 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Akap2O54931 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Akap2O54931 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Akap2O54931 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Akap2O54931 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Akap2O54931 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Akap2O54931 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Akap2O54931 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Akap2O54931 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Akap2O54931 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Akap2O54931 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Akap2O54931 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Akap2O54931 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Akap2O54931 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Akap2O54931 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Akap2O54931 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Akap2O54931 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Akap2O54931 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Akap2O54931 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Akap2O54931 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Akap2O54931 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Akap2O54931 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Akap2O54931 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Akap2O54931 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Akap2O54931 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Akap2O54931 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Akap2O54931 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Akap2O54931 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Akap2O54931 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Akap2O54931 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Akap2O54931 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Akap2O54931 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Akap2O54931 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Akap2O54931 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Akap2O54931 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Akap2O54931 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Akap2O54931 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Akap2O54931 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Akap2O54931 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Akap2O54931 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Akap2O54931 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Akap2O54931 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Akap2O54931 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Akap2O54931 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Akap2O54931 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Akap2O54931 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Akap2O54931 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Akap2O54931 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Akap2O54931 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Akap2O54931 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Akap2O54931 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Akap2O54931 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Akap2O54931 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Akap2O54931 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Akap2O54931 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Akap2O54931 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Akap2O54931 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Akap2O54931 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Akap2O54931 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Akap2O54931 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Akap2O54931 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Akap2O54931 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Akap2O54931 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Akap2O54931 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Akap2O54931 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Akap2O54931 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Akap2O54931 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Akap2O54931 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Akap2O54931 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Akap2O54931 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Akap2O54931 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Akap2O54931 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Akap2O54931 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Akap2O54931 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Akap2O54931 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Akap2O54931 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Akap2O54931 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Akap2O54931 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms