Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cavin1O54724 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cavin1O54724 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cavin1O54724 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cavin1O54724 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cavin1O54724 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cavin1O54724 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cavin1O54724 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cavin1O54724 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cavin1O54724 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Cavin1O54724 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cavin1O54724 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cavin1O54724 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cavin1O54724 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cavin1O54724 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cavin1O54724 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cavin1O54724 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cavin1O54724 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cavin1O54724 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cavin1O54724 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cavin1O54724 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cavin1O54724 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cavin1O54724 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cavin1O54724 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cavin1O54724 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cavin1O54724 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cavin1O54724 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cavin1O54724 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cavin1O54724 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cavin1O54724 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cavin1O54724 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cavin1O54724 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cavin1O54724 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cavin1O54724 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cavin1O54724 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cavin1O54724 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cavin1O54724 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cavin1O54724 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cavin1O54724 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cavin1O54724 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cavin1O54724 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cavin1O54724 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cavin1O54724 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cavin1O54724 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cavin1O54724 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cavin1O54724 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cavin1O54724 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cavin1O54724 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cavin1O54724 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cavin1O54724 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cavin1O54724 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cavin1O54724 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cavin1O54724 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cavin1O54724 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cavin1O54724 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cavin1O54724 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cavin1O54724 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cavin1O54724 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cavin1O54724 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cavin1O54724 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cavin1O54724 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cavin1O54724 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cavin1O54724 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cavin1O54724 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cavin1O54724 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cavin1O54724 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cavin1O54724 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cavin1O54724 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cavin1O54724 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cavin1O54724 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cavin1O54724 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms