Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP9BO43861 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP9BO43861 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP9BO43861 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP9BO43861 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP9BO43861 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP9BO43861 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP9BO43861 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP9BO43861 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP9BO43861 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP9BO43861 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP9BO43861 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP9BO43861 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP9BO43861 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP9BO43861 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP9BO43861 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP9BO43861 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP9BO43861 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP9BO43861 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP9BO43861 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP9BO43861 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP9BO43861 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP9BO43861 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP9BO43861 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP9BO43861 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP9BO43861 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP9BO43861 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP9BO43861 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP9BO43861 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP9BO43861 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP9BO43861 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP9BO43861 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP9BO43861 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP9BO43861 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP9BO43861 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP9BO43861 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP9BO43861 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms