Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYNGR2O43760 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYNGR2O43760 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYNGR2O43760 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYNGR2O43760 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms