Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFSF14O43557 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFSF14O43557 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFSF14O43557 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFSF14O43557 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFSF14O43557 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFSF14O43557 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFSF14O43557 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFSF14O43557 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFSF14O43557 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFSF14O43557 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFSF14O43557 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFSF14O43557 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFSF14O43557 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFSF14O43557 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFSF14O43557 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFSF14O43557 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFSF14O43557 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFSF14O43557 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFSF14O43557 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFSF14O43557 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFSF14O43557 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFSF14O43557 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFSF14O43557 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFSF14O43557 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFSF14O43557 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFSF14O43557 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFSF14O43557 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF14O43557 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF14O43557 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFSF14O43557 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFSF14O43557 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFSF14O43557 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFSF14O43557 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFSF14O43557 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFSF14O43557 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFSF14O43557 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFSF14O43557 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFSF14O43557 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFSF14O43557 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFSF14O43557 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFSF14O43557 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFSF14O43557 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFSF14O43557 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFSF14O43557 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFSF14O43557 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFSF14O43557 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFSF14O43557 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFSF14O43557 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFSF14O43557 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFSF14O43557 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFSF14O43557 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFSF14O43557 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFSF14O43557 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFSF14O43557 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFSF14O43557 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFSF14O43557 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFSF14O43557 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFSF14O43557 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFSF14O43557 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFSF14O43557 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFSF14O43557 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFSF14O43557 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFSF14O43557 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFSF14O43557 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFSF14O43557 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFSF14O43557 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFSF14O43557 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFSF14O43557 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFSF14O43557 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFSF14O43557 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFSF14O43557 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFSF14O43557 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFSF14O43557 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFSF14O43557 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFSF14O43557 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFSF14O43557 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFSF14O43557 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFSF14O43557 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFSF14O43557 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFSF14O43557 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFSF14O43557 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFSF14O43557 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFSF14O43557 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFSF14O43557 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFSF14O43557 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFSF14O43557 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFSF14O43557 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFSF14O43557 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFSF14O43557 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFSF14O43557 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF14O43557 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF14O43557 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF14O43557 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF14O43557 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFSF14O43557 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFSF14O43557 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFSF14O43557 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFSF14O43557 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFSF14O43557 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms