Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCEO43556 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCEO43556 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCEO43556 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCEO43556 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCEO43556 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCEO43556 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCEO43556 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCEO43556 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCEO43556 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCEO43556 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCEO43556 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCEO43556 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCEO43556 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCEO43556 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCEO43556 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCEO43556 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCEO43556 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCEO43556 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCEO43556 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCEO43556 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCEO43556 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCEO43556 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCEO43556 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCEO43556 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCEO43556 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCEO43556 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCEO43556 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCEO43556 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCEO43556 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCEO43556 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SGCEO43556 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGCEO43556 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SGCEO43556 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGCEO43556 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGCEO43556 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGCEO43556 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCEO43556 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCEO43556 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCEO43556 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCEO43556 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCEO43556 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCEO43556 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCEO43556 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCEO43556 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCEO43556 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCEO43556 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCEO43556 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCEO43556 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCEO43556 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCEO43556 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGCEO43556 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGCEO43556 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCEO43556 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCEO43556 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCEO43556 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCEO43556 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCEO43556 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCEO43556 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCEO43556 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCEO43556 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCEO43556 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCEO43556 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCEO43556 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCEO43556 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCEO43556 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCEO43556 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCEO43556 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCEO43556 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCEO43556 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCEO43556 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCEO43556 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCEO43556 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCEO43556 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCEO43556 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCEO43556 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCEO43556 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCEO43556 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCEO43556 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCEO43556 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCEO43556 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCEO43556 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCEO43556 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCEO43556 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCEO43556 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCEO43556 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGCEO43556 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCEO43556 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCEO43556 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCEO43556 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCEO43556 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCEO43556 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCEO43556 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCEO43556 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCEO43556 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCEO43556 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCEO43556 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCEO43556 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCEO43556 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCEO43556 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms