Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMAD6O43541 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMAD6O43541 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMAD6O43541 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD6O43541 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD6O43541 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD6O43541 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMAD6O43541 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMAD6O43541 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMAD6O43541 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMAD6O43541 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMAD6O43541 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMAD6O43541 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMAD6O43541 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMAD6O43541 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMAD6O43541 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMAD6O43541 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMAD6O43541 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMAD6O43541 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMAD6O43541 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMAD6O43541 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SMAD6O43541 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMAD6O43541 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMAD6O43541 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMAD6O43541 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMAD6O43541 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMAD6O43541 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMAD6O43541 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMAD6O43541 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SMAD6O43541 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMAD6O43541 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMAD6O43541 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMAD6O43541 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMAD6O43541 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMAD6O43541 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SMAD6O43541 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMAD6O43541 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMAD6O43541 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMAD6O43541 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMAD6O43541 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMAD6O43541 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMAD6O43541 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMAD6O43541 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMAD6O43541 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMAD6O43541 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMAD6O43541 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMAD6O43541 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SMAD6O43541 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMAD6O43541 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMAD6O43541 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMAD6O43541 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMAD6O43541 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMAD6O43541 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SMAD6O43541 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMAD6O43541 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMAD6O43541 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMAD6O43541 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMAD6O43541 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMAD6O43541 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMAD6O43541 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMAD6O43541 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMAD6O43541 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMAD6O43541 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMAD6O43541 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMAD6O43541 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMAD6O43541 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMAD6O43541 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMAD6O43541 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMAD6O43541 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SMAD6O43541 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SMAD6O43541 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMAD6O43541 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMAD6O43541 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMAD6O43541 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SMAD6O43541 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMAD6O43541 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMAD6O43541 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMAD6O43541 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SMAD6O43541 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMAD6O43541 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMAD6O43541 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SMAD6O43541 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD6O43541 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms