Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KCNQ2O43526 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KCNQ2O43526 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KCNQ2O43526 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KCNQ2O43526 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KCNQ2O43526 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KCNQ2O43526 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
KCNQ2O43526 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KCNQ2O43526 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KCNQ2O43526 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KCNQ2O43526 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KCNQ2O43526 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KCNQ2O43526 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KCNQ2O43526 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KCNQ2O43526 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KCNQ2O43526 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KCNQ2O43526 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
KCNQ2O43526 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
KCNQ2O43526 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KCNQ2O43526 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KCNQ2O43526 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KCNQ2O43526 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KCNQ2O43526 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KCNQ2O43526 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KCNQ2O43526 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
KCNQ2O43526 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
KCNQ2O43526 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KCNQ2O43526 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
KCNQ2O43526 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KCNQ2O43526 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KCNQ2O43526 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KCNQ2O43526 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KCNQ2O43526 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KCNQ2O43526 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KCNQ2O43526 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
KCNQ2O43526 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
KCNQ2O43526 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KCNQ2O43526 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KCNQ2O43526 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KCNQ2O43526 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.8■■■■□ 3
KCNQ2O43526 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
KCNQ2O43526 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.8■■■■□ 3
KCNQ2O43526 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
KCNQ2O43526 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KCNQ2O43526 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KCNQ2O43526 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
KCNQ2O43526 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KCNQ2O43526 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KCNQ2O43526 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
KCNQ2O43526 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KCNQ2O43526 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
KCNQ2O43526 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
KCNQ2O43526 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
KCNQ2O43526 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KCNQ2O43526 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KCNQ2O43526 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KCNQ2O43526 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KCNQ2O43526 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
KCNQ2O43526 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KCNQ2O43526 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KCNQ2O43526 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KCNQ2O43526 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KCNQ2O43526 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KCNQ2O43526 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KCNQ2O43526 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KCNQ2O43526 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KCNQ2O43526 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KCNQ2O43526 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
KCNQ2O43526 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
KCNQ2O43526 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
KCNQ2O43526 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KCNQ2O43526 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KCNQ2O43526 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
KCNQ2O43526 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KCNQ2O43526 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
KCNQ2O43526 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KCNQ2O43526 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
KCNQ2O43526 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
KCNQ2O43526 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KCNQ2O43526 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KCNQ2O43526 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KCNQ2O43526 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KCNQ2O43526 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KCNQ2O43526 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KCNQ2O43526 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KCNQ2O43526 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KCNQ2O43526 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KCNQ2O43526 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
KCNQ2O43526 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
KCNQ2O43526 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KCNQ2O43526 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KCNQ2O43526 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KCNQ2O43526 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
KCNQ2O43526 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
KCNQ2O43526 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
KCNQ2O43526 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KCNQ2O43526 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KCNQ2O43526 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
KCNQ2O43526 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
KCNQ2O43526 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms