Protein–RNA interactions for Protein: O43323

DHH, Desert hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHHO43323 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHHO43323 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHHO43323 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHHO43323 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHHO43323 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DHHO43323 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHHO43323 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHHO43323 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHHO43323 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHHO43323 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHHO43323 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHHO43323 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHHO43323 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHHO43323 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHHO43323 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHHO43323 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DHHO43323 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DHHO43323 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHHO43323 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHHO43323 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHHO43323 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHHO43323 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DHHO43323 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DHHO43323 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHHO43323 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHHO43323 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHHO43323 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHHO43323 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHHO43323 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHHO43323 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DHHO43323 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHHO43323 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHHO43323 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHHO43323 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHHO43323 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHHO43323 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHHO43323 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHHO43323 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHHO43323 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHHO43323 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHHO43323 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHHO43323 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHHO43323 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHHO43323 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHHO43323 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHHO43323 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHHO43323 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHHO43323 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHHO43323 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHHO43323 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHHO43323 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHHO43323 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHHO43323 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHHO43323 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHHO43323 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHHO43323 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHHO43323 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
DHHO43323 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHHO43323 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHHO43323 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHHO43323 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHHO43323 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHHO43323 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHHO43323 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHHO43323 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DHHO43323 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHHO43323 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DHHO43323 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DHHO43323 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DHHO43323 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DHHO43323 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DHHO43323 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DHHO43323 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DHHO43323 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DHHO43323 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DHHO43323 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DHHO43323 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DHHO43323 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DHHO43323 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHHO43323 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHHO43323 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHHO43323 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHHO43323 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHHO43323 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHHO43323 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DHHO43323 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DHHO43323 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHHO43323 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHHO43323 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHHO43323 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHHO43323 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHHO43323 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHHO43323 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHHO43323 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DHHO43323 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHHO43323 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHHO43323 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHHO43323 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHHO43323 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DHHO43323 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms