Protein–RNA interactions for Protein: O43307

ARHGEF9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF9O43307 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF9O43307 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGEF9O43307 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGEF9O43307 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF9O43307 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF9O43307 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF9O43307 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF9O43307 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF9O43307 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF9O43307 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF9O43307 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF9O43307 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF9O43307 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF9O43307 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF9O43307 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF9O43307 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF9O43307 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF9O43307 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF9O43307 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF9O43307 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF9O43307 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF9O43307 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF9O43307 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF9O43307 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ARHGEF9O43307 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF9O43307 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARHGEF9O43307 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF9O43307 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF9O43307 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF9O43307 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF9O43307 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARHGEF9O43307 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF9O43307 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARHGEF9O43307 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF9O43307 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF9O43307 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARHGEF9O43307 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF9O43307 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF9O43307 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF9O43307 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF9O43307 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF9O43307 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARHGEF9O43307 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF9O43307 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF9O43307 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF9O43307 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF9O43307 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF9O43307 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF9O43307 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARHGEF9O43307 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF9O43307 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGEF9O43307 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGEF9O43307 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF9O43307 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF9O43307 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF9O43307 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF9O43307 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF9O43307 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF9O43307 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGEF9O43307 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF9O43307 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF9O43307 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF9O43307 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF9O43307 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF9O43307 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF9O43307 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF9O43307 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF9O43307 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF9O43307 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF9O43307 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF9O43307 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF9O43307 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF9O43307 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms