Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHF1O43189 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF1O43189 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHF1O43189 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF1O43189 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF1O43189 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF1O43189 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF1O43189 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF1O43189 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF1O43189 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF1O43189 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF1O43189 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF1O43189 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF1O43189 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF1O43189 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF1O43189 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF1O43189 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF1O43189 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF1O43189 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF1O43189 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF1O43189 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF1O43189 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF1O43189 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF1O43189 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF1O43189 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF1O43189 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF1O43189 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHF1O43189 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF1O43189 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF1O43189 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF1O43189 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF1O43189 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF1O43189 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF1O43189 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF1O43189 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF1O43189 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF1O43189 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF1O43189 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF1O43189 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF1O43189 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF1O43189 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF1O43189 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF1O43189 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF1O43189 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF1O43189 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF1O43189 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF1O43189 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF1O43189 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF1O43189 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF1O43189 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF1O43189 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF1O43189 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF1O43189 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF1O43189 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF1O43189 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF1O43189 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF1O43189 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF1O43189 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF1O43189 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF1O43189 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHF1O43189 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHF1O43189 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF1O43189 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF1O43189 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF1O43189 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF1O43189 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF1O43189 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF1O43189 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF1O43189 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF1O43189 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF1O43189 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF1O43189 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF1O43189 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF1O43189 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF1O43189 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF1O43189 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF1O43189 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF1O43189 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF1O43189 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF1O43189 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF1O43189 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF1O43189 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF1O43189 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF1O43189 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF1O43189 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF1O43189 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHF1O43189 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHF1O43189 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHF1O43189 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF1O43189 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF1O43189 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHF1O43189 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF1O43189 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF1O43189 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF1O43189 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF1O43189 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF1O43189 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF1O43189 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF1O43189 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHF1O43189 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms