Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl25O35903 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl25O35903 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccl25O35903 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl25O35903 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms