Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klf9O35739 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Klf9O35739 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
Klf9O35739 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klf9O35739 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klf9O35739 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klf9O35739 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Klf9O35739 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf9O35739 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf9O35739 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf9O35739 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf9O35739 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Klf9O35739 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klf9O35739 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klf9O35739 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Klf9O35739 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf9O35739 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf9O35739 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf9O35739 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf9O35739 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf9O35739 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Klf9O35739 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klf9O35739 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Klf9O35739 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klf9O35739 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klf9O35739 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Klf9O35739 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Klf9O35739 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Klf9O35739 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf9O35739 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf9O35739 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf9O35739 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf9O35739 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Klf9O35739 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf9O35739 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf9O35739 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf9O35739 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf9O35739 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klf9O35739 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klf9O35739 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klf9O35739 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klf9O35739 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klf9O35739 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf9O35739 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf9O35739 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf9O35739 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf9O35739 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf9O35739 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf9O35739 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf9O35739 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klf9O35739 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf9O35739 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf9O35739 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf9O35739 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf9O35739 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Klf9O35739 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Klf9O35739 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Klf9O35739 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Klf9O35739 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Klf9O35739 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Klf9O35739 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Klf9O35739 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Klf9O35739 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Klf9O35739 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Klf9O35739 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Klf9O35739 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Klf9O35739 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Klf9O35739 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klf9O35739 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Klf9O35739 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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