Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf12O35738 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf12O35738 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klf12O35738 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klf12O35738 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf12O35738 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf12O35738 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf12O35738 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf12O35738 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf12O35738 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf12O35738 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Klf12O35738 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf12O35738 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klf12O35738 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf12O35738 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf12O35738 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf12O35738 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klf12O35738 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Klf12O35738 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf12O35738 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf12O35738 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf12O35738 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf12O35738 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klf12O35738 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf12O35738 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf12O35738 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klf12O35738 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf12O35738 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf12O35738 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf12O35738 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf12O35738 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf12O35738 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klf12O35738 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf12O35738 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klf12O35738 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf12O35738 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf12O35738 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf12O35738 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf12O35738 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf12O35738 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf12O35738 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf12O35738 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf12O35738 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf12O35738 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf12O35738 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf12O35738 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf12O35738 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf12O35738 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf12O35738 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf12O35738 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf12O35738 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf12O35738 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf12O35738 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf12O35738 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf12O35738 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf12O35738 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf12O35738 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf12O35738 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf12O35738 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf12O35738 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf12O35738 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf12O35738 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf12O35738 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf12O35738 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf12O35738 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf12O35738 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf12O35738 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf12O35738 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf12O35738 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf12O35738 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf12O35738 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf12O35738 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf12O35738 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klf12O35738 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf12O35738 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf12O35738 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf12O35738 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf12O35738 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf12O35738 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf12O35738 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Klf12O35738 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klf12O35738 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klf12O35738 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf12O35738 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf12O35738 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf12O35738 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf12O35738 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf12O35738 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf12O35738 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf12O35738 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf12O35738 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf12O35738 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf12O35738 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf12O35738 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Klf12O35738 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf12O35738 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Klf12O35738 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klf12O35738 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms